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两者区别如下：
一、概念不同
摩尔吸光系数，也称摩尔消光系数，是指浓度为1摩尔/升时的吸光系数，ε表示，当浓度用克/升表示时，摩尔吸光系数在数值上等于吸光系数（a）与物质的分子量（M）之积，ε=aM。ε值的大小反映吸收介质对光吸收的程度。
百分吸光系数指光线通过溶液或某一物质前的入射光强度与该光线通过溶液或物质后的透射光强度比值的对数，影响它的因素有溶剂、浓度、温度等等吸光指数与入射光的波长以及被光通过的物质有关。只要光的波长被固定下来，同一种物质，吸光指数就不变。
二、特性不同
摩尔吸光系数的大小与待测物、溶剂的性质及光的波长有关。待测物不同，则摩尔吸光系数也不同，所以，摩尔吸光系数可作为物质的特征常数。溶剂不同时，同一物质的摩尔吸光系数也不同，因此，在说明摩尔吸光系数时，应注明溶剂。光的波长不同，其吸光系数也不同。
由吸收光谱曲线可知，不同入射波长，具有不同的吸光度。在具有最大吸光度A值对应的波长，称为最大吸收波长。显然，最大吸收波长处，具有最大吸光系数。在 A=abc 式中，当b = 1 时，a值就是这个二元一次方程的斜率。斜率值越高，即灵敏度越高。
扩展资料：
摩尔吸收系数的实际作用：
当吸光物质的浓度为1mol/L，吸收池厚为1cm，以一定波长的光通过时，所引起的吸光度值A。ε值取决于入射光的波长和吸光物质的吸光特性，亦受溶剂和温度的影响。在实际应用中，ε可作为定性鉴定的参数，也可用以估量定量方法的灵敏度。
ε值越大，表示该有色物质对该波长光的吸收能力越强，显色反应越灵敏，反映了用吸光光度法测定该吸光物质的灵敏度越高。
同一物质与不同显色剂反应生成不同有色化合物时，具有不同的ε值，因此ε值也是选择显色反应的重要依据。但有的时候有色化合物的化学式不清楚，在这种情况下，常用吸光系数a值表示反应的灵敏度。
该指出的是，在实际分析工作中，不能直接取浓度为1mol/L的有色溶液来测定ε值，而是在适当的低浓度时测定该有色溶液的吸光度，通过计算求得ε值。?
百度百科-摩尔吸光系数
百度百科-吸光系数
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